115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1360 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  770    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  54.57 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  27.3 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  25.81 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  27.44 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  24.84 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  25.74 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  23.77 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  24.27 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  23.76 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  24.64 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01660  conserved hypothetical protein  34.58 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.722392  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  27.6 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  25.48 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  23.48 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  26.11 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  23.43 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  26.85 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  23.61 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  24.01 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  24.29 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  24.44 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  22.85 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  25.36 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  25.14 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  23.64 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  24.55 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  22.66 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  21.9 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  25.97 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  40 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2298  hypothetical protein  32.41 
 
 		 212 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  20.49 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  37.66 
 
 		 454 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  23.65 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  28.47 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  37.97 
 
 		 457 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  40 
 
 		 460 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  40 
 
 		 458 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  40 
 
 		 458 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  40 
 
 		 458 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  40 
 
 		 458 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  40 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  30.25 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  40 
 
 		 458 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.83 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  38.67 
 
 		 458 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  38.67 
 
 		 458 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  38.67 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  38.67 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  24.75 
 
 		 417 aa  50.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  23.28 
 
 		 401 aa  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  34.67 
 
 		 460 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1185  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  38.46 
 
 		 214 aa  49.7  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.719809  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0981  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  35.14 
 
 		 187 aa  49.7  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  35.44 
 
 		 448 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  32.97 
 
 		 493 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  36.71 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15952  predicted protein  36.67 
 
 		 123 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  33.68 
 
 		 457 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  29.47 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  32.97 
 
 		 489 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  23.35 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  27.51 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  32 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  30.59 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  30.59 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  24.19 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  33.88 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  36 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  36 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0536  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  34.21 
 
 		 180 aa  47.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  30.61 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58562  predicted protein  25.33 
 
 		 279 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0813846  normal  0.776229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  24 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  24.04 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  24.04 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  38.2 
 
 		 283 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49419  predicted protein  31.31 
 
 		 343 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  31.11 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  27.08 
 
 		 536 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  34.67 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.1 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0630  23S rRNA methyluridine methyltransferase  35.9 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  30.53 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  32.05 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  21.9 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  29.73 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1190  O-methyltransferase family 3  28.23 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  34.07 
 
 		 465 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  32.47 
 
 		 459 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  35.96 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1723  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 174 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.9969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>