48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2262 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  45.27 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  40.98 
 
 		 396 aa  303  5.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  39.49 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  39.9 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  38.83 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  38.17 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  35.61 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  35.81 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  32.06 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  34.78 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  34.37 
 
 		 419 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  33.07 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  30.92 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  32.6 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  32.92 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  32.21 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  25.88 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  28 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  23.44 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  25.89 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  27.16 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  24.46 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  25.21 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  25.86 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  28.76 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  28.06 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  26.28 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  23.53 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  25.48 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2473  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.08 
 
 		 222 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  25.55 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  23 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  32.58 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  25 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  25.13 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2480  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  38.36 
 
 		 214 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2602  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  29.09 
 
 		 217 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.27 
 
 		 667 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  29.46 
 
 		 228 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  25.41 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  34.07 
 
 		 460 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  35 
 
 		 174 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  23.06 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1317  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  37.21 
 
 		 216 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3924  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  40 
 
 		 217 aa  43.1  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  21.48 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  37.93 
 
 		 189 aa  42.7  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>