55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29160 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  861    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  71.19 
 
 		 418 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  64.99 
 
 		 400 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  57.18 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  50.83 
 
 		 411 aa  359  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  48.69 
 
 		 412 aa  355  6.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  49.41 
 
 		 414 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  52.38 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  48.94 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  45.24 
 
 		 423 aa  262  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  47.59 
 
 		 403 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  46.27 
 
 		 388 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  43.56 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  44.07 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  44.53 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  40.2 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  37.96 
 
 		 392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  43.48 
 
 		 428 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  39.51 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  45.7 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  37.17 
 
 		 474 aa  171  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  38.71 
 
 		 382 aa  166  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  34.56 
 
 		 396 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  33.15 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  36.34 
 
 		 372 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  35.54 
 
 		 381 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  36.02 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  36.02 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  36.02 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  34.98 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  31.07 
 
 		 477 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  34.99 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  32.84 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  35.23 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  33.08 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  27.01 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  33.6 
 
 		 358 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  30.23 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  26.57 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  27.99 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  24.13 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  22.54 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  27.17 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  24.92 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  25.2 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  23.86 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  25.36 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  21.61 
 
 		 357 aa  67  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  19.88 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  19.34 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  23.42 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  25.57 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  24.81 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  23.14 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  22.98 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>