46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3389 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  827    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  44.02 
 
 		 393 aa  347  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  40.36 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  41.43 
 
 		 408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  39.49 
 
 		 396 aa  292  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  38.5 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  37.99 
 
 		 433 aa  262  6e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  39.15 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  36.8 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  36.24 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  33.41 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  34.36 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  34.33 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  32.52 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  33.89 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  32.1 
 
 		 417 aa  189  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  33.51 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  23.15 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  23.21 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  24.15 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  21.53 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  20.63 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  26.01 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  20.28 
 
 		 487 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  20.99 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  20.99 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  20.99 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  22.18 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  22.89 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  21.36 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  23.29 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  21.17 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  20.27 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  30.36 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.34 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.811474  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  27.27 
 
 		 196 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  21.32 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  22.09 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  25.19 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  30.95 
 
 		 228 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  25.53 
 
 		 493 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  22.35 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.96 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  26.8 
 
 		 264 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  26.98 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.78 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>