39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1098 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  833    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  38.17 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  36.24 
 
 
399 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  32.99 
 
 
431 aa  207  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  35.07 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  32.21 
 
 
433 aa  197  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  30.18 
 
 
393 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  33.52 
 
 
383 aa  182  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  32.01 
 
 
394 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  29.97 
 
 
399 aa  136  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  28.65 
 
 
420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  29.37 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  28.76 
 
 
444 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  28.8 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  28.5 
 
 
401 aa  121  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  28.53 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  28.46 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  23.96 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  25.75 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  24.88 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  26.84 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  26.97 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  23.54 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  25.37 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  24.69 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  26.77 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  24.06 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  24.65 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  22.41 
 
 
358 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  23.73 
 
 
415 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  25.47 
 
 
388 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  24.55 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  23.49 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  23.48 
 
 
428 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  21.88 
 
 
385 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  22.28 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  22.48 
 
 
477 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  23.1 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>