58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4233 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  792    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  85.12 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  51.1 
 
 		 388 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  47.9 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  53.1 
 
 		 403 aa  296  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  48.98 
 
 		 428 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  48.81 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  46.44 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  46.43 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  49.02 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  46.06 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  45.76 
 
 		 407 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  42.57 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  42.65 
 
 		 422 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  42.68 
 
 		 411 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  44.68 
 
 		 438 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  49.16 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  42.96 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  46.08 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  40.19 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  41.76 
 
 		 443 aa  209  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  35.61 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  38.37 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  39.28 
 
 		 487 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  38.29 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  38.96 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  37.07 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  36.45 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  36.45 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  32.86 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  35.59 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  37.36 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  35.1 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  33.25 
 
 		 381 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  34.77 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  33.78 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  27.4 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  27.18 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  28.12 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  27.34 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  26.35 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  24.87 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  25.24 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  26.92 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  26.24 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  27.43 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  19.04 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  26.06 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.48 
 
 		 465 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  25.43 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.24 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.24 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.24 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.24 
 
 		 449 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  33.33 
 
 		 241 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2196  hypothetical protein  42.25 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1285  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumB  43.53 
 
 		 374 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00745486  normal  0.0225207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>