30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0477 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  205  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  61.22 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  58.43 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  34.69 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  34.48 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  37.66 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  41.18 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  40 
 
 		 118 aa  47.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  35.53 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  42.86 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  37.5 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  38.46 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  41.56 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  42.65 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  42.65 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  44.12 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  44.12 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  42.65 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  42.65 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  41.18 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1976  VanZ family protein  38.03 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.999512  normal  0.218225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  42.65 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  36.49 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  35.38 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  36 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  38.57 
 
 		 120 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  39.19 
 
 		 104 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  41.94 
 
 		 109 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  38.03 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>