82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0224 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0224  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  100 
 
 
485 aa  1014    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.851243  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4624  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.08 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.88 
 
 
705 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.43 
 
 
480 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  24.95 
 
 
492 aa  99.8  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  26.03 
 
 
740 aa  97.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  25.96 
 
 
476 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  25.73 
 
 
476 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7054  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.68 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.06 
 
 
480 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.06 
 
 
480 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7035  glycosyl hydrolase family 32 protein  35.03 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.52 
 
 
787 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  30.96 
 
 
331 aa  79.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.96 
 
 
511 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  21.67 
 
 
480 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000597  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.53 
 
 
484 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00625258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.57 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.62 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.11 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.77 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.86 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.24 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.67 
 
 
454 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3719  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.66 
 
 
482 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148821 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  22.74 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.1 
 
 
491 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  24.7 
 
 
497 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  27.49 
 
 
432 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0123  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.12 
 
 
518 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.875506  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.67 
 
 
1418 aa  61.6  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  24.78 
 
 
491 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3850  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.02 
 
 
319 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0183549  normal  0.803751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  27.33 
 
 
476 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1711  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.01 
 
 
480 aa  60.1  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0123374  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.76 
 
 
464 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  22.2 
 
 
754 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0733  Levanase  28.43 
 
 
664 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  22.22 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  25.73 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1779  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.51 
 
 
489 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000816672  hitchhiker  0.000000000446058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  24.68 
 
 
491 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.17 
 
 
491 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.17 
 
 
491 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0254  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.72 
 
 
496 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00518799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3658  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.47 
 
 
487 aa  56.6  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.22 
 
 
491 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.76 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1691  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.14 
 
 
479 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.100085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22440  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.78 
 
 
210 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  30.62 
 
 
1413 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3796  levanase  24.08 
 
 
652 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  24.01 
 
 
545 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  23.5 
 
 
545 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3182  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.3 
 
 
506 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  25 
 
 
818 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  24.57 
 
 
738 aa  51.2  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  28.84 
 
 
511 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1511  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.55 
 
 
487 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0607223  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0399  sucrose-6-phosphate hydrolase  22.8 
 
 
532 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000118801  hitchhiker  0.0000128463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2897  Levanase  27.23 
 
 
526 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.59 
 
 
494 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.59 
 
 
494 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  27.62 
 
 
545 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1603  Levanase  27.16 
 
 
507 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0908  sucrose-6-phosphate hydrolase e1  25.62 
 
 
451 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.106564  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  24.55 
 
 
487 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00060  beta-fructofuranosidase, putative  25.93 
 
 
519 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3624  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  25.87 
 
 
489 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.64 
 
 
470 aa  47.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05012  exoinulinase InuD (AFU_orthologue; AFUA_5G00480)  27.19 
 
 
1203 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  22.83 
 
 
473 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1530  Levanase  29.02 
 
 
551 aa  47.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  23.21 
 
 
467 aa  47  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4170  levanase  25.94 
 
 
566 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  22.44 
 
 
572 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1495  sucrose-6-phosphate hydrolase  20.75 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  23.96 
 
 
469 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0826  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.05 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.19 
 
 
545 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0821  levanase  25.41 
 
 
554 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.84807  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl515  sucrose-6-phosphate hydrolase  24 
 
 
483 aa  43.5  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>