38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0134 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1379    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  55.56 
 
 		 673 aa  790    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1042 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  23.24 
 
 		 704 aa  96.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1028 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  22.41 
 
 		 672 aa  94.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  26.32 
 
 		 658 aa  91.7  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  24.01 
 
 		 684 aa  85.5  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  31.13 
 
 		 672 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  31.08 
 
 		 856 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  23.21 
 
 		 673 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  33.63 
 
 		 633 aa  72  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  22.9 
 
 		 840 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1096 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  23.3 
 
 		 1225 aa  62.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  31.76 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  33.02 
 
 		 898 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  25.86 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  25.86 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  27.03 
 
 		 753 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  31.68 
 
 		 616 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 1338 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1433 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  26.92 
 
 		 624 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  33.73 
 
 		 342 aa  50.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  26.92 
 
 		 624 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  25.32 
 
 		 1431 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  27.18 
 
 		 664 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  23.6 
 
 		 633 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  28.06 
 
 		 647 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  29.59 
 
 		 1257 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1433 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  26.79 
 
 		 647 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.83 
 
 		 1256 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.83 
 
 		 1256 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  23.58 
 
 		 633 aa  43.9  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0510  hypothetical protein  25.81 
 
 		 673 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  24.31 
 
 		 1256 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>