More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1654 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1654  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 367 aa  748    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  71.31 
 
 		 367 aa  549  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  70.77 
 
 		 367 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  54.55 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  53.07 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  54.6 
 
 		 377 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  51.1 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  51.66 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  51.24 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  50.96 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  51.68 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  52.1 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  52.35 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 377 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 377 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  50.14 
 
 		 377 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  50.14 
 
 		 377 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  53.48 
 
 		 372 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 377 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 377 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 377 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 377 aa  358  8e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 377 aa  358  9e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  51.25 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  50.27 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  51.79 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  52.07 
 
 		 372 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  48.9 
 
 		 374 aa  352  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  49.3 
 
 		 376 aa  352  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  52.65 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  51.71 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 363 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 363 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  47.25 
 
 		 370 aa  348  7e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 		 370 aa  347  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  49.31 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  49.31 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  49.31 
 
 		 371 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  49.46 
 
 		 390 aa  346  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  51.79 
 
 		 370 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  51.79 
 
 		 370 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  49.3 
 
 		 366 aa  345  7e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  54.6 
 
 		 371 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  48.6 
 
 		 370 aa  344  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  50.41 
 
 		 371 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  50.84 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  48.76 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  51.79 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  51.53 
 
 		 372 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  46.01 
 
 		 371 aa  342  5e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 371 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 371 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 371 aa  342  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  47.8 
 
 		 372 aa  342  8e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19910  L-alanine dehydrogenase  50.82 
 
 		 380 aa  342  9e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.653017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  49.45 
 
 		 376 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  51.25 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  49.3 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  51.28 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  52.14 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  49.45 
 
 		 371 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  49.86 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  52.89 
 
 		 371 aa  339  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  48.48 
 
 		 371 aa  338  7e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  51.53 
 
 		 377 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  47.93 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  48.76 
 
 		 371 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  51.24 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  50.14 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  49.45 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  50.27 
 
 		 369 aa  336  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  50.56 
 
 		 370 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  51.27 
 
 		 371 aa  335  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  48.07 
 
 		 373 aa  335  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  50 
 
 		 369 aa  335  9e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  50.96 
 
 		 373 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  51.25 
 
 		 371 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3174  L-alanine dehydrogenase  50.28 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  50 
 
 		 371 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  52.75 
 
 		 370 aa  332  8e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  51.52 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  50.82 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  53.06 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>