31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1236 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  60.58 
 
 		 847 aa  1068    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  100 
 
 		 859 aa  1753    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  60.76 
 
 		 859 aa  1030    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  67.37 
 
 		 847 aa  1187    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  43.63 
 
 		 802 aa  662    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  39.83 
 
 		 800 aa  613  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  35.55 
 
 		 762 aa  528  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  35.33 
 
 		 764 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  35.05 
 
 		 753 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  44.04 
 
 		 734 aa  405  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  34.66 
 
 		 653 aa  220  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  32.97 
 
 		 658 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1050 aa  107  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  27.36 
 
 		 1071 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  27.9 
 
 		 1100 aa  89  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1144 aa  81.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  26.91 
 
 		 1031 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  27.06 
 
 		 1076 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  26.51 
 
 		 1046 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  25.25 
 
 		 1043 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  26.76 
 
 		 1104 aa  74.3  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  29.01 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  24.29 
 
 		 1106 aa  65.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  32.93 
 
 		 599 aa  50.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  23.49 
 
 		 523 aa  47.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  28.43 
 
 		 679 aa  45.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  35.23 
 
 		 524 aa  45.4  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  25.37 
 
 		 623 aa  45.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  27.72 
 
 		 593 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  26.98 
 
 		 524 aa  44.7  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  33.77 
 
 		 499 aa  44.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>