More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0485 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  864    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0672  hypothetical protein  70.02 
 
 		 414 aa  597  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000206571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1956  hypothetical protein  65.84 
 
 		 411 aa  548  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0016  hypothetical protein  50.9 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06088  hypothetical protein  50.13 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000288  8-amino-7-oxononanoate synthase/CqsA  49.07 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331723  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0456  hypothetical protein  50.27 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.882052  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3515  hypothetical protein  48.79 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4048  hypothetical protein  47 
 
 		 417 aa  358  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.139975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0774  hypothetical protein  67.09 
 
 		 255 aa  319  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2656  hypothetical protein  42.59 
 
 		 416 aa  313  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2787  hypothetical protein  42.29 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0771  hypothetical protein  60.87 
 
 		 187 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2943  aminotransferase class I and II  38.81 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  29.8 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  27.2 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  28.78 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  30.09 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  26.01 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.37 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  27.81 
 
 		 401 aa  163  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.77 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.3 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.17 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  26.74 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.6 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.62 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.74 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.45 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  27.64 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.71 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  28.75 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.79 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.79 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.79 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  28.96 
 
 		 401 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.41 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.51 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  27.17 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  29.24 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  27.41 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.65 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0351  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.15 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.44 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.71 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  28.77 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0328  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.86 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.971003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  24.93 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  25.58 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  28.78 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  28.88 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.88 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  26.07 
 
 		 395 aa  146  9e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  28.88 
 
 		 390 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  28.88 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  28.29 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  28.88 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.58 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.93 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.4 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  28.9 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.33 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3901  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.26 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0192612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.53 
 
 		 394 aa  143  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.54 
 
 		 396 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.83 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  26.78 
 
 		 396 aa  142  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.65 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84331  palmitoyl transferase  30.38 
 
 		 566 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.61 
 
 		 384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  26.4 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.12 
 
 		 388 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  27 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  29.18 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1659  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.18 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  28.62 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  28.32 
 
 		 400 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3938  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.81 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.542648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3792  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.28 
 
 		 406 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000577388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2189  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.37 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1051  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.9 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307967  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3945  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.57 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.3 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4674  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.64 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.84 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2094  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.491729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  25.8 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3900  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.92 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.339123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4104  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.92 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130063  normal  0.534575 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.19 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3954  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.19 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0183173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4045  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.72 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00116611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.19 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4990  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.19 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00350174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3992  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.92 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.061688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.06 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.95 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03475  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.19 
 
 		 398 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0091  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.19 
 
 		 398 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.541224  normal  0.282383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>