39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0106 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  100 
 
 		 221 aa  453  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  64.81 
 
 		 244 aa  291  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  63.72 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  59.17 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  50.7 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  50.22 
 
 		 250 aa  191  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  51.37 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  47.93 
 
 		 241 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  46.76 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  49.76 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  46.56 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  44.95 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  47.42 
 
 		 258 aa  134  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  43.05 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  40.96 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  41.15 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  37.27 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  41.05 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  41.75 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  40.72 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  37.58 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  31.73 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  38.89 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  37.82 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  36.29 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  38.52 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  38.66 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  38.66 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  38.66 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  36.97 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  34.68 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  27.74 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  34.43 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  34.45 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  36.97 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  36.97 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  36.97 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  36.97 
 
 		 235 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  29.66 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>