More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1449 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1449  peptide ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 316 aa  623  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000218444  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1754  peptide ABC transporter, permease protein  50.33 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0569132  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1934  peptide ABC transporter, permease protein  50.65 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1568  peptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 314 aa  271  8.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1653  peptide ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 		 316 aa  251  9.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.644278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  33.97 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2117  dipeptidase  37.87 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  33.97 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.97 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 321 aa  172  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 		 358 aa  172  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0171  hypothetical protein  32.56 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 		 338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  30.12 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  28.97 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0569  oligopeptide ABC transporter, permease  28.3 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  30.35 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.5 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  28.21 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  29.97 
 
 		 348 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  0.0000268959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  29.15 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.396259 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.74 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  30.38 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.781235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  27.9 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0445446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6176  ABC transporter, permease  28.39 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0736  peptide ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  30.99 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  30.67 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.81 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0063  ABC nickel transporter, inner membrane subunit  29.65 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.642958  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  29.71 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0752  ABC transporter, permease  28.94 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.59 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.692549  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.298513  hitchhiker  0.00733729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3005  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.78 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  28.53 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>