41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1291 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  65.89 
 
 		 223 aa  282  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  65.89 
 
 		 223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  65.42 
 
 		 223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  58.88 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  57.14 
 
 		 232 aa  244  9e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  54.13 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  53 
 
 		 230 aa  231  5e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  54.38 
 
 		 227 aa  228  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  47.64 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  31.51 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  28.24 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  25.19 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  32.26 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  27.17 
 
 		 275 aa  62  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  27.07 
 
 		 281 aa  61.6  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  25.78 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  28.65 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  24.03 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  30.05 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  27.24 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  30.39 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  30.77 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  29.02 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  32.37 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  28.65 
 
 		 283 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  24.02 
 
 		 274 aa  52  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  31.28 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  22.44 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  24.71 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  30.73 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  19.29 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  23.33 
 
 		 304 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  28.19 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  26.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  20.77 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  23.17 
 
 		 284 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  24.9 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  29.21 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  21.29 
 
 		 296 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  23.17 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>