56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1183 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1183  N-terminal methylation domain protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0706  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.769661  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0781  hypothetical protein  40.67 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.070782  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1323  hypothetical protein  40.67 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  34.62 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  24.31 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  28.57 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  27.45 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  28.66 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  32.1 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  36.99 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  38.75 
 
 		 210 aa  47.4  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  48.72 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  34.29 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1757  hypothetical protein  39.22 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  31.37 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  34.62 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  38.18 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  40 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  36.23 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  46.15 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  47.22 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  26.51 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  31.43 
 
 		 187 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  24.62 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  37.78 
 
 		 170 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  25.81 
 
 		 166 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  31.43 
 
 		 187 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  32.2 
 
 		 182 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  30.37 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  43.4 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  31.43 
 
 		 187 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  50 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  47.22 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  31.43 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  29.11 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  32.79 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  44.44 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  27.63 
 
 		 202 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  41.67 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  34.43 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  31.08 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  31.08 
 
 		 205 aa  40.8  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  31.08 
 
 		 205 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  39.62 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  53.33 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  35.19 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  31.08 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  31.08 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  44.44 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  41.67 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  43.59 
 
 		 163 aa  40.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  24.32 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  31.08 
 
 		 205 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  31.08 
 
 		 205 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  34.43 
 
 		 191 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>