More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2871 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2871  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
175 aa  343  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0086  phosphoribosyltransferase  45.77 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0083  phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
183 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.448882  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6228  phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
198 aa  88.6  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1409  phosphoribosyltransferase  41.35 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  27.63 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  30.52 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
424 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  38.18 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  26.39 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0821  adenine phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
188 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1834  adenine phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  26.39 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  26.39 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0881  adenine phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 
172 aa  61.6  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
172 aa  61.2  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
185 aa  60.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
174 aa  61.2  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  38.26 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>