238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0086 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0086  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0083  phosphoribosyltransferase  87.98 
 
 		 183 aa  311  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.448882  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2871  phosphoribosyltransferase  45.77 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6228  phosphoribosyltransferase  36.15 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1409  phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  32.58 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  26.92 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  30.89 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14411  adenine phosphoribosyltransferase  23.23 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  25.99 
 
 		 172 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  25.99 
 
 		 172 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 424 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  26.97 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  24.06 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  23.6 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  28.15 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  29.24 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  23.03 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 335 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_6834  predicted protein  28.44 
 
 		 143 aa  48.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>