193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6228 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6228  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
198 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2871  phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
175 aa  88.2  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0083  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.448882  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0086  phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
188 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
188 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0069  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1521  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.781785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
188 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1409  phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  33.08 
 
 
197 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  33.08 
 
 
216 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0493  adenine phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 
202 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  27.98 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 
175 aa  52  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  36.8 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
185 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
187 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
187 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
187 aa  51.2  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1005  adenine phosphoribosyltransferase  26.52 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3217  phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0934  adenine phosphoribosyltransferase  26.52 
 
 
182 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0887  adenine phosphoribosyltransferase  26.52 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
424 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2307  Adenine phosphoribosyltransferase  40.71 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0679858  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  37.9 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  33.66 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
184 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
170 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09083  adenine phosphoribosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_7G02310)  27.07 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000528084  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
170 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
172 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
181 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29461  adenine phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 
182 aa  48.1  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.268301  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
171 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
172 aa  47.8  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
183 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
172 aa  48.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2586  adenine phosphoribosyltransferase  35.77 
 
 
174 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
181 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  25.4 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
201 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
178 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0834  putative adenine phosphoribosyltransferase  30.15 
 
 
193 aa  47  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1044  adenine phosphoribosyltransferase  22.14 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1400  adenine phosphoribosyltransferase  26.15 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  26.89 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  26.28 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  26.89 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0802  adenine phosphoribosyltransferase  35 
 
 
172 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12604  adenine phosphoribosyltransferase  39.33 
 
 
223 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793855  normal  0.485658 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  35 
 
 
172 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  31.73 
 
 
181 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  30.17 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>