29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1104 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1104  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
330 aa  645    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0139226  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  36.74 
 
 
312 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2284  aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 
319 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2435  hypothetical protein  38.56 
 
 
321 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5744  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
302 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1890  hypothetical protein  32.52 
 
 
318 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.873685  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16000  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  31.37 
 
 
308 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1615  aminoglycoside phosphotransferase  35.45 
 
 
219 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5466  aminoglycoside phosphotransferase  29.57 
 
 
324 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  36.19 
 
 
190 aa  93.6  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  33.84 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3464  aminoglycoside phosphotransferase  29.83 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707829  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4674  hypothetical protein  31.23 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0914933  hitchhiker  0.00723319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1771  hypothetical protein  32.64 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0508  hypothetical protein  32.37 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1255  hypothetical protein  27.69 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4013  aminoglycoside phosphotransferase  28.51 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  hitchhiker  0.00393524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  28.18 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 
353 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  36.47 
 
 
343 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  44.23 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  25.86 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  32.97 
 
 
349 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  44.68 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  31.17 
 
 
353 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  30.14 
 
 
352 aa  42.7  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  37.14 
 
 
343 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>