More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08890 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08890  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
377 aa  755    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000459348  normal  0.752559 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  50.28 
 
 
345 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.21 
 
 
314 aa  300  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  47.06 
 
 
297 aa  164  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  32.58 
 
 
292 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  39.66 
 
 
307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.38 
 
 
286 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  43.45 
 
 
286 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  38.69 
 
 
285 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  42.77 
 
 
286 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  38.1 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  41.07 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  40.24 
 
 
234 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  29.31 
 
 
285 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  40.24 
 
 
300 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  36.09 
 
 
279 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  31.81 
 
 
282 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.11 
 
 
299 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  40.24 
 
 
319 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03431  putative protein methyltransferase  37.5 
 
 
289 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  42.6 
 
 
287 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  42.51 
 
 
283 aa  116  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  42.42 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.15 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03421  putative protein methyltransferase  36.9 
 
 
289 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.783711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  44.25 
 
 
285 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  47.75 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  37.95 
 
 
289 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  40 
 
 
276 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1627  modification methylase, HemK family  31.65 
 
 
305 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0476  HemK family modification methylase  40.91 
 
 
301 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540191  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.87 
 
 
321 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000102093  hitchhiker  0.0000000000956396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.03 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  38.15 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  39.05 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  26.97 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  37.72 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  37.87 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  35.16 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.18 
 
 
289 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.65 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.43 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  40.83 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  39.43 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  46.43 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.56 
 
 
288 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.55 
 
 
295 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  35.57 
 
 
314 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  47.75 
 
 
284 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  43.27 
 
 
289 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  37.5 
 
 
308 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0324  HemK family modification methylase  36.9 
 
 
289 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  38.01 
 
 
304 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  34.5 
 
 
289 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  36.84 
 
 
273 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  39.64 
 
 
278 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  33.93 
 
 
587 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  33.93 
 
 
587 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  41.42 
 
 
287 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  38.6 
 
 
292 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.97 
 
 
280 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  36.26 
 
 
273 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.48 
 
 
296 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1858  modification methylase HemK  38.33 
 
 
302 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  40.46 
 
 
317 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  41.48 
 
 
296 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.33 
 
 
286 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  36.78 
 
 
255 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  26.94 
 
 
361 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  35.33 
 
 
286 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  37.5 
 
 
301 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  41.07 
 
 
295 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  36.05 
 
 
297 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.36 
 
 
279 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.88 
 
 
287 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  44.34 
 
 
284 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  37.79 
 
 
298 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  35.15 
 
 
288 aa  104  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.42 
 
 
330 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4934  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.16 
 
 
299 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  37.87 
 
 
325 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  28.85 
 
 
281 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  42.59 
 
 
282 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.91 
 
 
299 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  38.6 
 
 
288 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
286 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4350  HemK family modification methylase  37.5 
 
 
280 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00937671  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.63 
 
 
297 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.84 
 
 
340 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.77 
 
 
317 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  37.35 
 
 
274 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.92 
 
 
277 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  39.1 
 
 
292 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03531  putative protein methyltransferase  36.69 
 
 
293 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.854566  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  41.18 
 
 
283 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.83 
 
 
296 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.12 
 
 
300 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  34.73 
 
 
301 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.2 
 
 
285 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.47 
 
 
322 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>