More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06470 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06470  RNase HI  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0800016  normal  0.300256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1704  ribonuclease H  51.75 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229425  normal  0.715434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  52.41 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  49.66 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  48.97 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  51.02 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  50.68 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  47.62 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  49.65 
 
 		 160 aa  136  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  48.97 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  48.97 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  48.98 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  48.98 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  48.98 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  48.98 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  48.98 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  48.98 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  48.98 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  48.98 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  50.34 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  50.34 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  50.34 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  48.28 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  47.65 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  45.95 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  47.65 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  45.27 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  46.58 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  48.32 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  48.97 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  43.92 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  44.83 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  46.62 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  48.65 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  48.65 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  46.62 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  47.59 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  48.28 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  48.28 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1763  ribonuclease H  48.97 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0424  ribonuclease H  48.97 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  46.62 
 
 		 151 aa  129  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  50.68 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  42.76 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  46.94 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0317  Ribonuclease H  47.26 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  45.64 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  45.64 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  45.64 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  44.52 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  45.89 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  46.72 
 
 		 527 aa  126  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  47.55 
 
 		 142 aa  126  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  45.27 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  44.22 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  45.27 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  42.76 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  47.59 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  47.62 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  45.64 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  45.27 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  45.14 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  45.27 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  43.45 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  45.64 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  45.83 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  47.22 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  45.83 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  43.92 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  44.37 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  45.83 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  44.3 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  47.95 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  46.62 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  42.57 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.99 
 
 		 532 aa  123  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  49.66 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  45.58 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  41.5 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  41.5 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  42.76 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  44.9 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  45.95 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  43.24 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  43.54 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  42.86 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  46.21 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  43.15 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  44.37 
 
 		 150 aa  120  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  45.07 
 
 		 235 aa  120  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  46.58 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  44.44 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  43.24 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  42.47 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  46.26 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  42.76 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  44.83 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  43.54 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  47.1 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  41.96 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>