184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2613 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  61.09 
 
 		 294 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  60.75 
 
 		 294 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  54.79 
 
 		 298 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  37.2 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  38.68 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  38.54 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  37.1 
 
 		 1264 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  36.73 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  37.06 
 
 		 1064 aa  169  7e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  33.84 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  35.21 
 
 		 1053 aa  159  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  32.96 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  33.58 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  34.55 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  32.45 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  33.09 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  31.85 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  29.64 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  31.85 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  31.85 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  31.85 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  32.21 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  32.58 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  31.53 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  32.07 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  32.07 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  32.95 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  31.66 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  33.08 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  33.63 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  30.36 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  33.07 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 		 409 aa  132  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  30.36 
 
 		 282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  32.31 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  31.54 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  30.61 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  31.68 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  33.62 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  31.8 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  30.56 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  31.54 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  30.45 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  31.82 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  32.45 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  30.94 
 
 		 613 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  30.92 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  32.08 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  30.17 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  32.53 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  34.84 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  29.64 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  29.64 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  32.08 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  30.96 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  30.61 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  32.06 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  32.06 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  30.15 
 
 		 277 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  29.54 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  32.06 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  31.15 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  30.5 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  33.49 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  29.39 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  29.29 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  28.19 
 
 		 610 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  32.39 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  31.3 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  32.59 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  29.37 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  31.05 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0342  phosphatidylserine decarboxylase  30.71 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1509  phosphatidylserine decarboxylase  29.33 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.121972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  32.42 
 
 		 262 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  31.44 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  31.44 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  31.44 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  31.44 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  31.44 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  31.44 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  28.36 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  31.44 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  31.06 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>