More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0613 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
428 aa  874    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  70.42 
 
 
426 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.37 
 
 
425 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.11 
 
 
425 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.6 
 
 
424 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.27 
 
 
429 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.24 
 
 
424 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.37 
 
 
425 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.32 
 
 
425 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  56.03 
 
 
422 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  52.96 
 
 
425 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.91 
 
 
427 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.59 
 
 
429 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  53.11 
 
 
431 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  49.41 
 
 
431 aa  438  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.12 
 
 
430 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  50.83 
 
 
431 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.76 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.33 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.12 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.24 
 
 
439 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  47.2 
 
 
427 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.51 
 
 
434 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.1 
 
 
430 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  46.96 
 
 
436 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.48 
 
 
442 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.36 
 
 
432 aa  391  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.73 
 
 
433 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  47.21 
 
 
428 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.02 
 
 
433 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.63 
 
 
430 aa  378  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  47.49 
 
 
433 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.78 
 
 
433 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.17 
 
 
435 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.55 
 
 
429 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.82 
 
 
430 aa  365  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.2 
 
 
434 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.62 
 
 
431 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  45.32 
 
 
428 aa  363  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  45.26 
 
 
423 aa  362  9e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.97 
 
 
426 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.82 
 
 
429 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  43.69 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  45.02 
 
 
426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.71 
 
 
425 aa  355  7.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  43.19 
 
 
429 aa  353  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  45.99 
 
 
425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  43.69 
 
 
428 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  43.69 
 
 
428 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  43.69 
 
 
428 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  43.69 
 
 
428 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  43.69 
 
 
428 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  43.69 
 
 
428 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  43.69 
 
 
428 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  43.46 
 
 
428 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  45.55 
 
 
428 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  48.04 
 
 
425 aa  349  5e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.73 
 
 
429 aa  348  8e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  43.22 
 
 
428 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  43.22 
 
 
428 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  42.59 
 
 
427 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.54 
 
 
448 aa  345  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  44.55 
 
 
426 aa  343  4e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  42.75 
 
 
430 aa  343  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.35 
 
 
425 aa  342  7e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  44.36 
 
 
425 aa  342  9e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  41.41 
 
 
423 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.69 
 
 
420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.65 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  42.69 
 
 
425 aa  333  4e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.84 
 
 
433 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.85 
 
 
473 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  43.17 
 
 
446 aa  331  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  41.88 
 
 
431 aa  330  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  42.92 
 
 
430 aa  329  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.38 
 
 
438 aa  329  6e-89  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  43.74 
 
 
425 aa  329  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  43.74 
 
 
425 aa  329  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  42.82 
 
 
428 aa  328  8e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.87 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.41 
 
 
497 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  41.72 
 
 
432 aa  325  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.77 
 
 
437 aa  323  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  41.95 
 
 
433 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  41.92 
 
 
446 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0816  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.86 
 
 
424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  40.99 
 
 
432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  41.25 
 
 
432 aa  319  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0502  dihydroorotase  42.75 
 
 
417 aa  319  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.98 
 
 
497 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  40.98 
 
 
431 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.88 
 
 
419 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  41.01 
 
 
448 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.49 
 
 
419 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0755  dihydroorotase multifunctional complex type  41.69 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  40.88 
 
 
454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  39.42 
 
 
431 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  39.95 
 
 
447 aa  312  6.999999999999999e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  43.13 
 
 
422 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  40.29 
 
 
458 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>