20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3494 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3494  hypothetical protein  100 
 
 		 852 aa  1669    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0571399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  27.96 
 
 		 756 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  47.69 
 
 		 957 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  25.63 
 
 		 762 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  42.65 
 
 		 902 aa  56.6  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  50 
 
 		 974 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1230  hypothetical protein  33.6 
 
 		 726 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.909152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  25.22 
 
 		 811 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  26.79 
 
 		 671 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  33.63 
 
 		 781 aa  53.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1312  hypothetical protein  50 
 
 		 472 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  27.73 
 
 		 824 aa  51.2  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1604  hypothetical protein  34.38 
 
 		 134 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1993  hypothetical protein  42.11 
 
 		 191 aa  48.5  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0769561  hitchhiker  0.00451154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3128  hypothetical protein  47.92 
 
 		 193 aa  48.5  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3315  Phage tail tape measure protein  56.41 
 
 		 858 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157558  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  34.34 
 
 		 174 aa  45.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3078  hypothetical protein  36.25 
 
 		 116 aa  45.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  37.08 
 
 		 674 aa  44.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  46 
 
 		 991 aa  44.3  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>