31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0108 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 550 aa  1050    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  46.29 
 
 		 554 aa  340  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  46.86 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  46.31 
 
 		 554 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  37.57 
 
 		 553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  34.07 
 
 		 376 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  38.45 
 
 		 527 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  35.53 
 
 		 577 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  38.04 
 
 		 375 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  33.57 
 
 		 574 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  32.43 
 
 		 371 aa  183  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  32.1 
 
 		 375 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  36.12 
 
 		 457 aa  170  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  30.91 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  30.21 
 
 		 375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04871  hypothetical protein  33.53 
 
 		 176 aa  67  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  23.1 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  21.97 
 
 		 387 aa  57  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  21.33 
 
 		 367 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  20.89 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  22.08 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  19.83 
 
 		 369 aa  51.2  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1215  hypothetical protein  32.41 
 
 		 233 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.932644  normal  0.206964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2993  saccharopine dehydrogenase  24.63 
 
 		 354 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2884  hypothetical protein  27.91 
 
 		 176 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  22.67 
 
 		 405 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2482  hypothetical protein  23.67 
 
 		 172 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  19.83 
 
 		 378 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  25.99 
 
 		 382 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  33.57 
 
 		 376 aa  44.3  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>