More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3501 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.31 
 
 
469 aa  891    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  100 
 
 
469 aa  934    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 
459 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  33.19 
 
 
461 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
470 aa  257  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  35.27 
 
 
469 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
462 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.96 
 
 
477 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 
438 aa  233  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  40.11 
 
 
486 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
452 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
509 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
469 aa  216  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  33.76 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
504 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  33.47 
 
 
481 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  30.93 
 
 
457 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  40.12 
 
 
490 aa  207  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
500 aa  205  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  30.85 
 
 
457 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  30.85 
 
 
457 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  32.71 
 
 
436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
436 aa  196  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  33.57 
 
 
436 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  39.93 
 
 
592 aa  193  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
484 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  36.14 
 
 
466 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
500 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.26 
 
 
466 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  35.67 
 
 
443 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
490 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  35.52 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  29.5 
 
 
427 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
524 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
478 aa  183  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  37.32 
 
 
364 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
495 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  37.32 
 
 
364 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  32.27 
 
 
477 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
475 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
469 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  32.04 
 
 
448 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
515 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
444 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
447 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
455 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  32.99 
 
 
449 aa  177  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
466 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
478 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
487 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  36.96 
 
 
430 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  36.96 
 
 
430 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  35.64 
 
 
471 aa  176  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  33 
 
 
456 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
466 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
468 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  38.91 
 
 
431 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  32.03 
 
 
503 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  34.44 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  34.44 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  31.87 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
364 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  34.38 
 
 
436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  32.14 
 
 
478 aa  173  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  38.59 
 
 
475 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  38.91 
 
 
459 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
466 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
491 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
490 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1491  histidine kinase  30.6 
 
 
444 aa  172  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.31 
 
 
447 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
459 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  38.52 
 
 
476 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  30.27 
 
 
454 aa  170  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  33.77 
 
 
357 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  33.81 
 
 
436 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  34.23 
 
 
466 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
480 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
487 aa  170  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  35.74 
 
 
483 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  36.48 
 
 
436 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
458 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  36.48 
 
 
484 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  33.44 
 
 
357 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  32.13 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  36.67 
 
 
484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>