32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1179 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1174    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  37.13 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  24.49 
 
 		 566 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  24.92 
 
 		 580 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1143  hypothetical protein  33.1 
 
 		 147 aa  94.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  23.58 
 
 		 656 aa  67  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  22.94 
 
 		 848 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0547  hypothetical protein  29.45 
 
 		 640 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  24.19 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  22.52 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.8 
 
 		 611 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  38.55 
 
 		 142 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0816  zinc finger SWIM domain protein  34.95 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  22.18 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  23.38 
 
 		 266 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2110  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.35 
 
 		 129 aa  52  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  22.22 
 
 		 613 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.84 
 
 		 1087 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  36.47 
 
 		 605 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.17 
 
 		 601 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0899  hypothetical protein  35.21 
 
 		 641 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  30.89 
 
 		 1084 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1077  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.76 
 
 		 142 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0899  zinc finger SWIM domain protein  31.71 
 
 		 603 aa  47.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.727484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1317  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.94 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  35.9 
 
 		 1077 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  34.57 
 
 		 1062 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0551  hypothetical protein  22.92 
 
 		 701 aa  44.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1672  zinc finger, SWIM-type  34.52 
 
 		 131 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0138295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3318  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0735  hypothetical protein  35.9 
 
 		 639 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>