49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6802 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  100 
 
 
239 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  31.03 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  32.53 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  34.2 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  32.41 
 
 
626 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  28.82 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  37.28 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  37.28 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  37.28 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  39.02 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  32.93 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  33.93 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  34.55 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  35.12 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  30.81 
 
 
221 aa  58.9  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  35.88 
 
 
228 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  37.09 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  35.39 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  35.76 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  31.93 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  28.64 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  37.5 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  28.9 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  36.94 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  36.75 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  35.06 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  36.72 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  36.72 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  28.97 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  30.93 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  31.29 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  33.77 
 
 
220 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2729  hypothetical protein  26.74 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000838492  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  31.29 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  31.71 
 
 
597 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  31.29 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  31.29 
 
 
216 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  31.29 
 
 
216 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  31.29 
 
 
216 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  34.15 
 
 
597 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  31.29 
 
 
216 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  30.3 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  26.82 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  34.34 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  30.86 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  34.06 
 
 
223 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  23.61 
 
 
212 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2687  YhhN family protein  30.34 
 
 
223 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0177327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  35.5 
 
 
214 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>