32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4946 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  100 
 
 		 589 aa  1202    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  54.65 
 
 		 572 aa  611  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  52.61 
 
 		 681 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  48.5 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  46.65 
 
 		 593 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  31.85 
 
 		 743 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  32.14 
 
 		 545 aa  251  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  31.98 
 
 		 572 aa  173  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  30.99 
 
 		 814 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  35.05 
 
 		 516 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 502 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  26.97 
 
 		 475 aa  134  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  27.49 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  30.9 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  31.43 
 
 		 621 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  29.87 
 
 		 900 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  31.65 
 
 		 566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  29.77 
 
 		 584 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 		 343 aa  107  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  27.18 
 
 		 335 aa  97.8  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 335 aa  96.3  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  24.26 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  26.03 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  26.14 
 
 		 673 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  25.64 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  24.83 
 
 		 378 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 332 aa  55.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  33.75 
 
 		 1069 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 359 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.27 
 
 		 985 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  22.94 
 
 		 1302 aa  43.9  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>