31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3706 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
823 aa  1633    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.46 
 
 
1109 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.5 
 
 
1212 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  39.73 
 
 
671 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  38.76 
 
 
675 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  35.77 
 
 
1000 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.26 
 
 
1410 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  33.21 
 
 
1091 aa  253  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  31.89 
 
 
1213 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.18 
 
 
933 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.97 
 
 
584 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  27.86 
 
 
1085 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  29.78 
 
 
1200 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  27.79 
 
 
1418 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.91 
 
 
1448 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.11 
 
 
1001 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  24.81 
 
 
981 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.86 
 
 
795 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  48.34 
 
 
510 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3309  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.66 
 
 
208 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.03 
 
 
685 aa  57.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  24.38 
 
 
424 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  40.79 
 
 
2169 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  31.86 
 
 
1736 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  35.17 
 
 
1070 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  36.17 
 
 
1626 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 
1332 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.97 
 
 
372 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  34.58 
 
 
1428 aa  45.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  36.14 
 
 
571 aa  44.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3905  parallel beta-helix repeat protein  41.67 
 
 
926 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0449733  normal  0.0115545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>