22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2821 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  47.47 
 
 		 470 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  50.51 
 
 		 161 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  49.44 
 
 		 418 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 392 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 282 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  36.84 
 
 		 405 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  41.94 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  40.86 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  46.67 
 
 		 403 aa  82.4  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  49.32 
 
 		 475 aa  79  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  42.7 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  42.86 
 
 		 497 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 443 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 443 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  32.58 
 
 		 107 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  70 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  30.49 
 
 		 549 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 460 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  35 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>