More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2767 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2767  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2514  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.63 
 
 
406 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883804  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27830  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  52.99 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.92 
 
 
294 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.67 
 
 
328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0999  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 
326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
602 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0783  ABC transporter related  44.71 
 
 
295 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.806728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1340  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  41.31 
 
 
342 aa  196  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.801873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  44.19 
 
 
586 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2381  ABC transporter related  42.86 
 
 
273 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0184159  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  46.15 
 
 
282 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
316 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.78 
 
 
333 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2200  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 
332 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.492449  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1634  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.14 
 
 
334 aa  193  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.666215  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
282 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 
276 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5063  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 
327 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5646  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.11 
 
 
330 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3078  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.06 
 
 
338 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111325  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.38 
 
 
339 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0032  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
346 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 
327 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 
551 aa  191  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 
669 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 
338 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0160  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.5 
 
 
320 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0749  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
312 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.760141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  44.19 
 
 
310 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  46.12 
 
 
544 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 
336 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.94 
 
 
326 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0807  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.26 
 
 
323 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  47.08 
 
 
569 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0235  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.55 
 
 
337 aa  188  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.29 
 
 
325 aa  188  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  41.38 
 
 
552 aa  188  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  42.51 
 
 
549 aa  188  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  48.25 
 
 
597 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1017  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
351 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  43.3 
 
 
551 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1004  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
323 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  40.54 
 
 
640 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0811  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
326 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1000  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
323 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.90335e-62 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1552  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 
324 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0949  oligopeptide transport ATP-binding protein AppF  37.39 
 
 
323 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3136  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
321 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170739  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  47.66 
 
 
285 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0826  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
326 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  43.3 
 
 
551 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  47.23 
 
 
285 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  48.18 
 
 
544 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  41.86 
 
 
562 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  46.72 
 
 
307 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.57 
 
 
326 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0863  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
326 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  45.16 
 
 
261 aa  186  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0912  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 
323 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4382  oligopeptide transport ATP-binding protein AppF  37.39 
 
 
323 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4282  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 
330 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1050  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.05 
 
 
310 aa  185  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.863922  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.23 
 
 
339 aa  185  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  38.85 
 
 
308 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  43.97 
 
 
617 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6652  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 
355 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  44.54 
 
 
561 aa  185  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  43.35 
 
 
549 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0446  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.5 
 
 
313 aa  185  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3302  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.47 
 
 
326 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 
615 aa  185  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  50 
 
 
554 aa  184  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  41.53 
 
 
629 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2801  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 
334 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0725461  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.98 
 
 
366 aa  184  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5084  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.380048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  40.38 
 
 
599 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2855  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847801  normal  0.650854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  40.15 
 
 
623 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0077  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.59 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.221676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  41.64 
 
 
552 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1901  ABC transporter related  38.82 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  40.15 
 
 
623 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3054  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.75 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  48.31 
 
 
555 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 
339 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.67 
 
 
571 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  41.85 
 
 
593 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  43.03 
 
 
576 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6153  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  42.75 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798522  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 
339 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2086  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP- binding protein  45.49 
 
 
320 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441479  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
539 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  40.93 
 
 
624 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  45.85 
 
 
546 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  47.68 
 
 
588 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  46.96 
 
 
540 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0189  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>