40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3395 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  100 
 
 		 156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  63.38 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  52.24 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  48.82 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  47.2 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  57.66 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  51.22 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  41.13 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  45.33 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  45.33 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  40.44 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  40.44 
 
 		 154 aa  90.9  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  48.85 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  32.05 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  37.9 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  36.17 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  34.69 
 
 		 171 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  35.29 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  35.83 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  39.47 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  32.14 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  36.57 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  38.3 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  35.07 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  37.1 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  36.78 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  28.04 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  28.44 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  30.37 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  40.32 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  37.1 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  29.32 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  31.5 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  32.79 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  25.87 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  33.33 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  25.42 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>