54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3097 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  100 
 
 		 179 aa  374  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  34.08 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  31.76 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  32.57 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  32.16 
 
 		 177 aa  94.4  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  31.95 
 
 		 170 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  31.36 
 
 		 167 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  28.57 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  31.11 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  31.29 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  30 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  29.45 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  29.05 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  26.42 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  29.34 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  27.22 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  27.22 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  26.45 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  26.95 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  25.73 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  29.01 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  27.81 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  31.07 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  26.35 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  25.3 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  24.71 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  26.16 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  25.86 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  27.22 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  29.09 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  25.86 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  26.86 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  28.48 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  28.05 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  28.05 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  25.31 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  26.35 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  26.7 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  24.2 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  23.08 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  24.03 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  24.14 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  29.3 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0488  DinB family protein  35.85 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3680  pentapeptide repeat protein  24.1 
 
 		 266 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0611357  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  41.86 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  23.12 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2138  dinB protein  24.84 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  24.22 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  19.77 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2397  DNA polymerase, DinB family  23.6 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  23.87 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2379  DinB family DNA polymerase  23.6 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2215  DinB family DNA polymerase  23.6 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>