23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1842 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  41.61 
 
 		 1627 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  43.14 
 
 		 2142 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  36.79 
 
 		 1193 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  37.25 
 
 		 1465 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  37.25 
 
 		 1687 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  31.16 
 
 		 1455 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  32.62 
 
 		 1479 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  35.85 
 
 		 1193 aa  68.6  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 812 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  40.19 
 
 		 1069 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  39.05 
 
 		 1236 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  33.01 
 
 		 970 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  34 
 
 		 1295 aa  65.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  33.66 
 
 		 693 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  29.7 
 
 		 601 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.98 
 
 		 1424 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  39.22 
 
 		 1206 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  31.63 
 
 		 693 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  32.69 
 
 		 1119 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  42.42 
 
 		 932 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  33 
 
 		 1108 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  37.33 
 
 		 1355 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>