59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI03980 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI03980  translation initiation factor, putative  100 
 
 
543 aa  1108    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00811612  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00978  eukaryotic translation initiation factor subunit eIF2B-gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16660)  24.1 
 
 
582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.903663  normal  0.846946 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64224  translation initiation factor eIF2B subunit  30.82 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167221  normal  0.261571 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46656  predicted protein  22.58 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  36.71 
 
 
835 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  44.26 
 
 
836 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.58 
 
 
836 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  38.81 
 
 
835 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81885  translation initiation factor eIF-2B epsilon subunit, GEF  34.07 
 
 
726 aa  61.6  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.541559  normal  0.64637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  27.2 
 
 
835 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  32.46 
 
 
370 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  34.62 
 
 
363 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
836 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2952  nucleotidyl transferase  26.58 
 
 
505 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  34.38 
 
 
836 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.43 
 
 
776 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31337  predicted protein  28.57 
 
 
371 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10459  translation initiation factor eif-2b epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12530)  26.87 
 
 
704 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 
359 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 
359 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 
359 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1974  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  24.07 
 
 
434 aa  50.4  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  31.19 
 
 
349 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  33.06 
 
 
365 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  34.96 
 
 
359 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  27.88 
 
 
820 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  32.5 
 
 
370 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46479  translation initiation factor eif-2bgamma  23.16 
 
 
758 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.67 
 
 
842 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 
359 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  28.05 
 
 
843 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  29.11 
 
 
370 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_969  predicted protein  22.48 
 
 
693 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  28.21 
 
 
357 aa  47  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  29.27 
 
 
841 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  26.44 
 
 
348 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  29.2 
 
 
388 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1419  nucleotidyl transferase  27.07 
 
 
414 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0198372  hitchhiker  0.00414302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  29.11 
 
 
370 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1307  nucleotidyl transferase  27.14 
 
 
413 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  25.87 
 
 
828 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  43.1 
 
 
223 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  32.53 
 
 
830 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  27.84 
 
 
818 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  34.13 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  24.36 
 
 
364 aa  45.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.98 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1037  nucleotidyl transferase  28.87 
 
 
409 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000127553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  34.78 
 
 
387 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  29.03 
 
 
346 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0967  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 
407 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117198  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.05 
 
 
842 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  29.87 
 
 
326 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  24.27 
 
 
837 aa  44.3  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
842 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  25.64 
 
 
854 aa  43.5  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1423  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
475 aa  43.5  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  28.04 
 
 
367 aa  43.5  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>