More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2439 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 382 aa  782    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  57.33 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  53.65 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  55.12 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  51.85 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  49.61 
 
 		 405 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  48.41 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  45.95 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1939  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  44.3 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  42.93 
 
 		 406 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  42.13 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  41.33 
 
 		 403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  42.13 
 
 		 406 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  40.91 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  39.63 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  38.67 
 
 		 406 aa  273  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  39.08 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  38.48 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  38.27 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  39.02 
 
 		 372 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  37.74 
 
 		 377 aa  252  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  37.94 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  37.94 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  37.94 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  37.94 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  37.94 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  37.94 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  37.94 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  37.94 
 
 		 377 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  37.94 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  37.94 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  39.04 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  37.67 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  37.4 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  39.06 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  39.08 
 
 		 372 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  37.16 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  38.04 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  35.75 
 
 		 379 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  36.66 
 
 		 370 aa  239  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  39.3 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  37.98 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  36.61 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  38.42 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  35.62 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  37.8 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  38.36 
 
 		 374 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  38.92 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  39.04 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  37.4 
 
 		 370 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  37.67 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  38.36 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  38.36 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  37.13 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  38.08 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  35.38 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  39.72 
 
 		 374 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  38.08 
 
 		 371 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  37.81 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  36.97 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  36.39 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  36.78 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  36.86 
 
 		 370 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  33.97 
 
 		 371 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  40.05 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  33.97 
 
 		 371 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  33.97 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  36.83 
 
 		 371 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  37.26 
 
 		 371 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  36.99 
 
 		 373 aa  225  9e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  36.09 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  36.99 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  37.26 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  37.9 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  36.03 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  38.24 
 
 		 376 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  37.57 
 
 		 371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  38.23 
 
 		 371 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  37.77 
 
 		 377 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  38.72 
 
 		 372 aa  222  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  38.42 
 
 		 374 aa  222  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  36.71 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  35.1 
 
 		 371 aa  222  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  36.73 
 
 		 371 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  34.6 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  39.83 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  39.51 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  38.34 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  35.52 
 
 		 371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  38.04 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  38.04 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>