223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1773 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  46.96 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  44.2 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  44.75 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  40.11 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  44.26 
 
 		 209 aa  158  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  40.22 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  39.78 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  39.56 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  38.12 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  35.16 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  36.26 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  37.91 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  34.25 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  32.6 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  32.79 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  33.51 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  33.15 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  33.7 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  32.64 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  33.16 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  33.16 
 
 		 190 aa  104  6e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  32.26 
 
 		 198 aa  104  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  31.61 
 
 		 191 aa  104  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  32.12 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  33.52 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  32.62 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  33.88 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  30.85 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  34.44 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  31.79 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  35.96 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  29.02 
 
 		 192 aa  94.4  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  29.5 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  35.11 
 
 		 205 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  31.76 
 
 		 200 aa  92  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  30.56 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  32.2 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  31.69 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  31.69 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  31.69 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  34.5 
 
 		 187 aa  90.9  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  28.88 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  28.88 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  28.88 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  28.04 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  31.79 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  29.78 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  32.78 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  31.69 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  29.55 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  31.11 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  32.2 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  30.06 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  29.41 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  29.55 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  32.2 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  32.2 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  32.2 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  31.11 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  29.59 
 
 		 195 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  32.02 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  30.73 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  30.73 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  31.46 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  29.95 
 
 		 202 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  29.38 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  31.64 
 
 		 216 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  32.75 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  32.02 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  29.38 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  30.17 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  29.61 
 
 		 197 aa  85.1  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  28.8 
 
 		 201 aa  85.1  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  25 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  29.89 
 
 		 216 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  30.29 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  29.21 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  29.78 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  28.65 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  30.9 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  29.24 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  30.17 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  29.78 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  31.07 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  30.64 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  25.95 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  29.78 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  28.96 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  31.79 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  29.63 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  28 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  31.21 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  31.21 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  31.21 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  31.21 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>