25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1681 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1681  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  747    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1030  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2001  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0783856  normal  0.0172593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2164  Tetratricopeptide domain protein  24.75 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  0.621045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.9 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0827  hypothetical protein  23.47 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.748424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5445  hypothetical protein  23.99 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  0.835503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.42 
 
 		 818 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.42 
 
 		 784 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1746  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  31.75 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 3560 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  22.19 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 955 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 543 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 602 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  24.66 
 
 		 548 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 465 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 4079 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.64 
 
 		 2240 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.11 
 
 		 738 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.72 
 
 		 512 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 1737 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.75 
 
 		 1979 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>