More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0202 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 287 aa  589  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  45.42 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  42.86 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  39.78 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  41.51 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  46.79 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  38.87 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  41.64 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  40.31 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  43.64 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  35.79 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  39.08 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  39.01 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  38.29 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.55 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  32.52 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  34.62 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  39.45 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  33.48 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.34 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  35.14 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  33.46 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  37.61 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  33.97 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.93 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  36.55 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.25 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  35.88 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  37.33 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  35.66 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  37.84 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  33.09 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.53 
 
 		 296 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.02 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  36.72 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  30.6 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  35.02 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  37.26 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.36 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.17 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.5 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.01 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  34.55 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  33.49 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  30.43 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  32.16 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  31.01 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  32.32 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.4 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  32.81 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  32.44 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  34.7 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2191  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.961515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2153  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.11 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  36.73 
 
 		 262 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.12 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  34.51 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  32.66 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  33.98 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  35.83 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  33.08 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  29.75 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  30.99 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.42 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.47 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  34.68 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.68 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  34.42 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  35.24 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.63 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  31.88 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  32.03 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  39.01 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.2 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  31.21 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  31.65 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  29.88 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  32 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  35.14 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  32.3 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  30.77 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.28 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  31.15 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.92 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  31.28 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  34.26 
 
 		 307 aa  115  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  31.5 
 
 		 283 aa  116  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.73 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.87 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.73 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  33.1 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.86 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  35.06 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  32.44 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  34.38 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  33.92 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  35.83 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  31.62 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>