More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0068 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0068  adenylate kinase  100 
 
 
200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3381  adenylate kinase  58.82 
 
 
189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  57.37 
 
 
190 aa  221  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5094  adenylate kinase  53.27 
 
 
202 aa  212  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0838  adenylate kinase  49.74 
 
 
195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  48.99 
 
 
374 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  50 
 
 
367 aa  183  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  49.47 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1863  adenylate kinase  44.68 
 
 
389 aa  168  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  43.09 
 
 
189 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0266  hypothetical protein  39.68 
 
 
193 aa  157  7e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.500283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  40.86 
 
 
188 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  40.38 
 
 
217 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  43.24 
 
 
181 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  43.24 
 
 
181 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  43.24 
 
 
181 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  42.16 
 
 
187 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  43.32 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  42.78 
 
 
360 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  38.46 
 
 
213 aa  154  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  41.08 
 
 
189 aa  154  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  39.81 
 
 
217 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  39.13 
 
 
215 aa  153  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  37.26 
 
 
214 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  41.97 
 
 
341 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  36.57 
 
 
216 aa  151  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  36.57 
 
 
216 aa  151  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  39.62 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  41.03 
 
 
367 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  44.15 
 
 
205 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  40.43 
 
 
185 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  41.46 
 
 
213 aa  150  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  42.47 
 
 
205 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  37.67 
 
 
215 aa  149  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  41.71 
 
 
195 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  42.25 
 
 
309 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  39.42 
 
 
215 aa  148  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  39.42 
 
 
216 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  37.97 
 
 
197 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  36.62 
 
 
215 aa  148  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  36.62 
 
 
215 aa  148  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  39.13 
 
 
215 aa  147  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  39.25 
 
 
191 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  36.92 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  37.89 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  37.26 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  40.93 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  37.26 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  39.07 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  40.11 
 
 
181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  38.71 
 
 
186 aa  145  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  41.88 
 
 
193 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  44.92 
 
 
335 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  37.21 
 
 
219 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  39.18 
 
 
208 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  40 
 
 
182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  43.85 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  36.84 
 
 
192 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  37.62 
 
 
208 aa  144  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  38.03 
 
 
219 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  39.57 
 
 
184 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  42.7 
 
 
187 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  36.15 
 
 
215 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  38.34 
 
 
204 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  36.32 
 
 
217 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  35.98 
 
 
214 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2598  adenylate kinase  38.25 
 
 
191 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.179524  normal  0.692202 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  39.11 
 
 
214 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  36.15 
 
 
217 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  35.35 
 
 
217 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  41.62 
 
 
181 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  35.35 
 
 
217 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  36.06 
 
 
216 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  40.98 
 
 
186 aa  142  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  37.84 
 
 
183 aa  141  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  41.85 
 
 
195 aa  141  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  37.74 
 
 
215 aa  141  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  36.06 
 
 
216 aa  141  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  36.06 
 
 
216 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  36.06 
 
 
216 aa  141  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  36.06 
 
 
216 aa  141  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  36.06 
 
 
216 aa  141  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  37.96 
 
 
214 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  36.06 
 
 
216 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  36.06 
 
 
216 aa  141  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  39.38 
 
 
200 aa  141  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  38.04 
 
 
192 aa  141  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  35.98 
 
 
214 aa  140  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  35.85 
 
 
217 aa  140  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  38.5 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09780  Adenylate kinase  36.95 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  38.92 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  36.06 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  39.04 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  37.26 
 
 
222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  36.06 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  35.58 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0615  adenylate kinase  40.11 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000660087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  36.32 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  35.19 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>