263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1067 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1067  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  275  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0851  hypothetical protein  61.03 
 
 
133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00201789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1981  hypothetical protein  61.07 
 
 
134 aa  154  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1238  hypothetical protein  58.02 
 
 
132 aa  150  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0769  hypothetical protein  56.82 
 
 
135 aa  147  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0694  hypothetical protein  55.3 
 
 
135 aa  144  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1331  hypothetical protein  55.3 
 
 
135 aa  143  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0752  conserved hypothetical protein (UPF0079 domain protein)  53.85 
 
 
135 aa  135  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1024  protein of unknown function UPF0079  41.32 
 
 
143 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1150  hypothetical protein  38.64 
 
 
137 aa  94  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.864213  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  36.19 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  35.24 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  36.04 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  39.77 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2083  hypothetical protein  31.09 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  31.88 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  39.76 
 
 
163 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  34.86 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf806  hypothetical protein  36.75 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  40.74 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  34.91 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  31.86 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  29.77 
 
 
176 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  31.91 
 
 
161 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2026  hypothetical protein  29.52 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  34.58 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  37 
 
 
161 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2004  hypothetical protein  30.25 
 
 
162 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  31 
 
 
169 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  34.09 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  30.85 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  28.07 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  31.25 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  32.35 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  38.55 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  32.33 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  35.96 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  33.61 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  32.54 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  37.36 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 
152 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  31.91 
 
 
192 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
159 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2756  protein of unknown function UPF0079  29.75 
 
 
160 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  31.03 
 
 
159 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  31.39 
 
 
189 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1306  hypothetical protein  32.5 
 
 
181 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134603  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  34.62 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0525  hypothetical protein  32.22 
 
 
177 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244934 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1704  protein of unknown function UPF0079  35.96 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44845  normal  0.0233413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  36.46 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1130  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.30959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  32.8 
 
 
164 aa  50.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  32.93 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0734  hypothetical protein  28.21 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2586  hypothetical protein  28.21 
 
 
171 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  33.72 
 
 
178 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  31.11 
 
 
184 aa  50.4  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
192 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  32.26 
 
 
188 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1951  hypothetical protein  28.21 
 
 
171 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  37.36 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2562  hypothetical protein  28.21 
 
 
198 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  34.62 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  31.33 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  32.95 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  38.75 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  34.62 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  31.91 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  30.21 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2481  hypothetical protein  28.21 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0482851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  32.14 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  34.52 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  29 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2610  hypothetical protein  28.21 
 
 
198 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2018  protein of unknown function UPF0079  29.67 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  35.56 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0596  hypothetical protein  34.09 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  32.35 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  26.43 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  29.75 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  28.57 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0908  hypothetical protein  28.57 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  30.08 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  28.57 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5894  hypothetical protein  27.35 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  31.73 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0911  hypothetical protein  28.57 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  31.73 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1852  protein of unknown function UPF0079  32.35 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.562422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  31.73 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  32.58 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  33.73 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  28.57 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  31.78 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  31.03 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>