More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0051 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 147 aa  286  6e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  89.04 
 
 		 147 aa  266  5.9999999999999995e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  89.12 
 
 		 158 aa  263  4e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  86.3 
 
 		 147 aa  261  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  88.44 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  88.44 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  88.44 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1951  ribosomal protein S5  87.67 
 
 		 147 aa  256  8e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  86.11 
 
 		 146 aa  249  8.000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  77.62 
 
 		 146 aa  222  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  64.08 
 
 		 166 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  64.75 
 
 		 166 aa  179  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  60.69 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  64.75 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  64.75 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  64.75 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  64.75 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  64.75 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  64.75 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  64.75 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  64.75 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  64.75 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  63.38 
 
 		 166 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  60.26 
 
 		 182 aa  176  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  58.33 
 
 		 206 aa  171  1.9999999999999998e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  61.15 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  60.87 
 
 		 180 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  61.87 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  59.15 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  59.15 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  59.15 
 
 		 164 aa  167  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  60.14 
 
 		 180 aa  167  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  60.56 
 
 		 166 aa  167  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  60.43 
 
 		 167 aa  166  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  60.14 
 
 		 179 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  60.56 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  58.27 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  58.99 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  58.27 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  58.27 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  55.32 
 
 		 169 aa  163  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  60.43 
 
 		 234 aa  162  9e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  58.82 
 
 		 153 aa  163  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  59.15 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  57.55 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  53.57 
 
 		 190 aa  161  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  59.15 
 
 		 166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  55.8 
 
 		 166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  57.04 
 
 		 169 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  57.04 
 
 		 169 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  56.12 
 
 		 163 aa  160  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  59.71 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  57.04 
 
 		 169 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  62.14 
 
 		 167 aa  159  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  56.93 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  56.93 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  55.4 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  52.41 
 
 		 167 aa  158  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  62.69 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  54.68 
 
 		 166 aa  157  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  62.69 
 
 		 166 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  62.69 
 
 		 166 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  61.31 
 
 		 208 aa  157  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  57.04 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  49.31 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  55.32 
 
 		 168 aa  157  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  48.63 
 
 		 167 aa  156  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  56.64 
 
 		 162 aa  156  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  48.63 
 
 		 167 aa  156  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  48.63 
 
 		 167 aa  156  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  48.63 
 
 		 167 aa  156  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  50.69 
 
 		 168 aa  156  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  54.86 
 
 		 167 aa  156  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  54.93 
 
 		 225 aa  156  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  51.03 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  51.03 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  47.95 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 162 aa  155  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3507  30S ribosomal protein S5  54.81 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000462246  hitchhiker  0.0000000928534 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  56.62 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  55.86 
 
 		 222 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  54.74 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  55.03 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  54.68 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  56.25 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  47.26 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  53.24 
 
 		 166 aa  154  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  47.26 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  58.27 
 
 		 197 aa  154  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  54.36 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  58.57 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  55.88 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  55.47 
 
 		 172 aa  154  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  47.95 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  47.95 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  54.74 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  52.52 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  47.95 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>