58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0869 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0869  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
251 aa  503  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2126  rod shape-determining protein MreC  80.33 
 
 
239 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1351  rod shape-determining protein MreC  56.84 
 
 
248 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.457737  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0318  rod shape-determining protein MreC  61.61 
 
 
234 aa  271  8.000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.462848  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1396  rod shape-determining protein MreC  49.6 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  46.56 
 
 
249 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  46.56 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0188  rod shape-determining protein MreC  44.53 
 
 
248 aa  223  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0250391  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  46.15 
 
 
236 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1466  rod shape-determining protein MreC  35.63 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  25.36 
 
 
333 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 
355 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 
358 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 
358 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 
358 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  23.05 
 
 
359 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  25.85 
 
 
271 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  25.38 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  22.47 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 
448 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  31.31 
 
 
338 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 
315 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 
356 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 
356 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 
272 aa  45.4  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
359 aa  45.4  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  25.28 
 
 
299 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  45.45 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  23.89 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  38.6 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  36.51 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25.58 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  36.05 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  23.68 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  22.91 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  22.68 
 
 
336 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  26.03 
 
 
369 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  31.46 
 
 
296 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  23.41 
 
 
309 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
274 aa  42  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  23.38 
 
 
367 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  26.85 
 
 
306 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  24.04 
 
 
355 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  24.39 
 
 
334 aa  42  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>