68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0424 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  643    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  33.95 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  34.26 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  34.01 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  31.25 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  32.57 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  32.12 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  31.27 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  34.46 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  32.45 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  31.65 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  29.27 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  25.55 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  24.92 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  23.02 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  24.25 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.66 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  23.3 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  21.38 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.55 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.24 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  23.38 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.69 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.54 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  22.99 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.64 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  23.05 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  19.74 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  29.17 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3501  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.9 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00652225  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1488  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.11 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.92 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  22.93 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1765  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0427  hypothetical protein  24.86 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2537  putative taurine ABC transporter, substrate binding protein  27.32 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237782  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1644  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.67 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.789892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  19.88 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1211  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.52 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0144  twin-arginine translocation pathway signal  22.51 
 
 		 413 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0774  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.53 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0489455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4979  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.47 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213313  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0257  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.953427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0233  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.786536  decreased coverage  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2183  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  26.52 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.680381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1455  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  25.7 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0248  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0698542  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2382  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  24.44 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0421  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  27.62 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1051  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.44 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.588314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1045  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  24.44 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0353  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  27.62 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7163  taurine ABC transporter periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2707  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  24.44 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00947  hypothetical protein  24.44 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.525571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3846  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4373  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  22.64 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00940  alkanesulfonate transporter subunit  24.44 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2660  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  24.44 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.536053  normal  0.0112507 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0026  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  33.98 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.778935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1098  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  24.44 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0897398  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  22.43 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0032  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  24.73 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5578  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>