58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2174 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  100 
 
 		 81 aa  157  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  88.89 
 
 		 84 aa  144  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 82 aa  107  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  52.05 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  49.35 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  52.05 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  50 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  48 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  43.84 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  44 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  48.68 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  39.51 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  46.75 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  40 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  40 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  40.85 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  40.85 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  40.26 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  32.1 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  34.62 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  32.91 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  35.8 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  32.05 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  35.44 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0779  phosphopantetheine-binding protein  30.14 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1510  phosphopantetheine-binding  29.27 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  29.49 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 81 aa  44.3  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 81 aa  44.3  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  34.85 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  31.67 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  27.4 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1769  acyl carrier protein  28.12 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0117852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1849  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000445968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  27.4 
 
 		 82 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>