More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13493 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13493  peptide ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 349 aa  701    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.31 
 
 		 351 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.46 
 
 		 350 aa  332  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000752871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3225  dipeptide ABC transporter, permease component  48.32 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  34.4 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  35.06 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  34.74 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  34.74 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.06 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  32.7 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4455  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  33.62 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 		 308 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  32.15 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  33.43 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  32.49 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  33.15 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  33.15 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  31.25 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  31.69 
 
 		 339 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 		 313 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 		 321 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 		 313 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  33.8 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  32.87 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.59 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  33.91 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.59 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  31.59 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  31.97 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  32.69 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 		 305 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  31.59 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  31.74 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  31.97 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  31.32 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  31.59 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  33.06 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  30.94 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.22 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 		 306 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  31.62 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.59 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  31.62 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  31.62 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  31.62 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  31.62 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  31.79 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5290  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  32.56 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728282  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  30.81 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  31.79 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  31.71 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  31.79 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  31.79 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.73 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  31.79 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  31.79 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  31.79 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  31.79 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  31.79 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>