More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03925 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03925  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 340 aa  699    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  69.28 
 
 		 341 aa  488  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  66.67 
 
 		 338 aa  474  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  57.82 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  56.72 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  57.65 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  54.28 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5839  UDP-glucose 4-epimerase  55.82 
 
 		 343 aa  357  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  51.5 
 
 		 339 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  52.55 
 
 		 336 aa  342  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  52.25 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  52.25 
 
 		 338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  48.65 
 
 		 339 aa  338  8e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  51.65 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  51.64 
 
 		 351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  50.9 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  51.35 
 
 		 337 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  52.25 
 
 		 337 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  51.65 
 
 		 338 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  51.95 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  51.35 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  51.65 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  51.05 
 
 		 338 aa  332  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 336 aa  332  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  51.35 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  51.65 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  51.35 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  329  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  48.63 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  329  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  52.55 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  329  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  51.05 
 
 		 337 aa  329  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 336 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 		 337 aa  328  6e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  51.65 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  51.65 
 
 		 338 aa  328  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 		 335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  48.35 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  48.35 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  48.35 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  48.35 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  48.35 
 
 		 338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  48.65 
 
 		 340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  48.05 
 
 		 337 aa  325  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  48.35 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3395  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  48.35 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  47.15 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  48.64 
 
 		 341 aa  324  1e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  48.5 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  48.8 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  47.43 
 
 		 340 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  47.15 
 
 		 336 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  46.57 
 
 		 337 aa  322  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 340 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 		 336 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 340 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 		 338 aa  322  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  48.95 
 
 		 338 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  48.95 
 
 		 338 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  47.43 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  47.43 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  48.5 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  49.7 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  48.64 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  48.96 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  46.55 
 
 		 342 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  48.65 
 
 		 338 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  45.95 
 
 		 336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  46.99 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  45.95 
 
 		 339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  47.75 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  48.05 
 
 		 336 aa  318  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  48.04 
 
 		 341 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  46.83 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  47.43 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2838  UDP-glucose 4-epimerase  46.85 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  47.43 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 339 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>