79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0929 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0929  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 322 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520778  normal  0.417573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0694  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.36 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101106  normal  0.0226571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4373  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2349  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.65 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4286  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766351  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.73 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  26.73 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4859  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0843259 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3507  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  25.97 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3846  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.57 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1528  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  31.03 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30470  putative periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  32.35 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1765  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.22 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1455  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  27.63 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.22 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.22 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0800  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  29.68 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0047  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0299581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  25.82 
 
 		 327 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1372  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  29.53 
 
 		 351 aa  49.3  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  22.27 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2365  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.36 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.626028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.51 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4326  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.23 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1152  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.76 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4880  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.57 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.779449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1469  aliphatic compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.13 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3293  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.78 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0577  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.88 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5871  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.31 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1644  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.35 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.789892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5955  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  24 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.764168  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.22 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2222  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  29.94 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.22 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4304  phosphonate-binding periplasmic protein  29.41 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0012  ABC transporter substrate-binding protein  23.66 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31400  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  30.77 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0670501  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  27.75 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2777  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  27.1 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0641341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  27.24 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4434  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.74 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1785  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  25.54 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2885  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  31.03 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3233  phosphonate-binding periplasmic protein  26.74 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.73019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3932  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.74 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0335865  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  26.45 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2479  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  31.03 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5064  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.9 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133964  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0622  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0123615  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2135  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  29.3 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.72 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4061  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.13 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00627715  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7590  hypothetical protein  24.4 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.222143  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  28.95 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.52 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1272  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  26.25 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3007  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.57 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0286  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  26.25 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0103216  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7929  ABC transporter substrate binding protein  21.95 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0556  aliphatic compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.25 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.409832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2528  aliphatic compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.25 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1303  aliphatic compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.25 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2952  NMT1/THI5 like domain protein  25.51 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0026  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  28.48 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.778935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1012  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  26.25 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  26.64 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  25 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.06 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4519  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.13 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0796811  normal  0.833846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0350  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  28.57 
 
 		 311 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5823  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.33 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  hitchhiker  0.00768111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.72 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0032  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  27.81 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6677  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.29 
 
 		 323 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250197  normal  0.232288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  23.5 
 
 		 339 aa  42.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  26.53 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>